Ministerstvo životného prostredia vydalo Výnos č. 3/2004-5.1, ktorým sa vydáva národný zoznam území európskeho významu s účinnosťou od 1. 8. 2004. V územiach od tohto dátumu platí tzv. predbežná ochrana a teda navrhovaný stupeň ochrany. 86% nÚEV sa prekrýva so súčasnou sústavou chránených území – na tejto ploche nedochádza k zásadnej zmene stupňov ochrany.
